杨森

发布时间:2023-05-29浏览次数:2033


 

杨森

博士、讲师

 常州大学

计算机与人工智能学院  阿里云大数据学院  软件学院

 

江苏常州 213164

 E-MAIL: ys@cczu.edu.cn

 

 

教育背景:

2018.09-2021.06  吉林大学 计算机应用技术 工学博士

2015.09-2018.06  吉林大学 软件工程 工学硕士

2011.09-2015.06  湖北科技学院应用数学理学学士

工作履历:

2022.01-今 常州第二人民医院,博士后

2021.10-今 常州大学大数据学院,专任教师

主授课程:

操作系统、Linux运维技术、软件安全

研究领域:

计算生物学、序列分析、肿瘤标志物挖掘、蛋白质特殊位点识别


招生:

期待编程能力较好、熟悉编程,对机器学习、深度学习感兴趣的学生(本科、研究生)加入,邮件发送个人简历到ys@cczu.edu.cn。主要科研任务为发表SCI期刊论文。

奖励与荣誉:

江苏省“双创博士”

学术成果:

Ø 发表论文

SCI论文

[1]. Yang Sen*, Yang Zixi, Yang Jun, 4mCBERT: A Computing Tool for the Identification of DNA N4-methylcytosine Sites by Sequence- and Chemical-Derived Information Based on Ensemble Learning Strategies, International Journal of Biological Macromolecules, vol. 231, p. 123180, Mar. 2023, doi: 10.1016/j.ijbiomac.2023.123180, 第一作者, IF=8.025, JCR=Q1, 中科院一区, Top期刊

[2]. Feng Hongqi, Wang Shaocong, Wang Yan, Ni Xinye, Yang Zexi, Hu Xuemei, Yang Sen*, LncCat: An ORF Attention Model to Identify LncRNA Based on Ensemble Learning Strategy and Fused Sequence Information. Computational and Structural Biotechnology Journal 2023:S2001037023000582. https://doi.org/10.1016/j.csbj.2023.02.012, 通信作者, IF=6.155, JCR=Q1, 中科院二区

[3]. Zhu Lun, Ye Chenyang, Hu Xuemei, Yang Sen*, Zhu Chenyang, ACP-check: An Anticancer Peptide Prediction Model Based on Bidirectional Long Short-Term Memory and Multi-Features Fusion Strategy, Computers in Biology and Medicine. 148 2022105868. https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2022.10 5868, 通信作者, IF=6.698, JCR=Q1, 中科院二区

[4]. Yang Sen, Wang Yan*, Zhang Shuangquan, Hu Xuemei, Ma Qin and Tian Yuan, NCResNet: Noncoding Ribonucleic Acid Prediction Based on a Deep Resident Network of Ribonucleic Acid Sequences, Frontiers in Genetics. 11 202090. https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00090, 第一作者, IF=3.258, JCR=Q1, 中科院二区.

[5]. Wang Yan, Zhu Xiaopeng, Yang Lili, Hu Xuemei, He Kai, Yu Cuinan, Jiao Shaoqing, Chen Jiali, Guo Rui, Yang Sen*, IDDLncLoc: Subcellular Localization of LncRNAs Based on a Framework for Imbalanced Data Distributions, Interdisciplinary Sciences-Computational Life Sciences. 14 2022409–420. https://doi.org/10.1007/s12539-021-00497-6, 通信作者, IF=2.233, JCR=Q2, 中科院三区

[6]. Wang Yan, Guo Rui, Huang Lan, Yang Sen*, Hu Xuemei, He Kai, A Predictor for N6-Methyladenosine Sites Identification Utilizing Sequence Characteristics and Graph Embedding-Based Geometrical Information, Frontiers in Genetics. 12 2021670852. https://doi.org/10.3389/fgene.2021.670852, 通信作者, IF=3.258, JCR=Q1, 中科院三区.

[7]. Wang Yan, Yang Sen, Zhao Jing, Du Wei, Liang Yanchun, Wang Cankun, Zhou Fengfeng, Tian Yuan*, Ma Qin, Using Machine Learning to Measure Relatedness Between Genes: A Multi-Features Model, Scientific Reports. 9 20194192. https://doi.org/10.1038/s41598-019-40780-7, IF=3.998, JCR=Q1, 中科院三区, 被引用33

教研论文

[1]. 王岩, 杨森, 黄岚, 王康平, 邹淑雪. 大数据分析与应用课程体系构建. 计算机教育, 2020 (2), CCF 推荐中文科技期刊C类(计算机教育优秀论文奖)

Ø 专利成果

[1]. 一种基于目标检测的胶体金类别判断的方法

[2]. 基于CatBoost算法的长非编码RNA识别方法

[3]. 基于双向长短期记忆网络与特征融合的抗癌肽预测方法

[4]. 基于FPGA1080P视频流编码加速平台

研究项目:


1.国家自然科学基金面上项目,62072212融合多组学数据的胰腺癌体液标志物精准挖掘与机理研究,在研,参与

2.常州市基础研究计划(应用基础研究),在研,主持

3.常州大学学生课外创新创业,结题,主持


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